Barry Baltus meraih pole position pertamanya di kelas Moto2, mengalahkan Joe Roberts dengan selisih 0,020 detik di sirkuit Brno. Diogo Moreira dan Aron Canet menghadapi tantangan dalam kualifikasi, dengan Moreira jatuh di sesi kedua dan Canet terjatuh di Tikungan 10. Kualifikasi Moto2 berlangsung dalam cuaca yang baik, diawali dengan Q1 yang menegangkan. Diogo Moreira, Daniel Holgado, dan nama-nama besar lainnya berusaha untuk lolos ke Q2. Namun, keberuntungan tidak berpihak pada Moreira yang terjatuh di sesi kedua.
Meskipun Moreira terlibat dalam kecelakaan, para pembalap lainnya berhasil mengatasi tantangan dan Barry Baltus menjadi pesaing terkuat di Q2. Deretan pembalap lain termasuk Manu Gonzalez, Jake Dixon, dan Marcos Ramirez menempati posisi tertinggi di barisan depan. Joe Roberts berhasil mengalahkan Baltus dalam pertarungan sengit, tetapi akhirnya Baltus meraih pole position dengan waktu tercepat 1:58,322 detik.
Barisan depan juga diisi oleh Daniel Holgado, Senna Agius, dan Mattia Pasini. Sementara itu, Aron Canet berjuang setelah terjatuh dan berada di urutan ke-18. Hasil kualifikasi Moto2 di Republik Ceko menunjukkan persaingan yang ketat dan tiada henti di antara para pembalap untuk meraih posisi terdepan dalam balapan yang akan datang.